¿Encontrar un haplogrupo a través de datos de ADN sin procesar?

Obtuve mi haplogrupo Y-DNA de mi archivo de ADN sin procesar AncestryDNA utilizando el primer método detallado en este enlace: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

En resumen, pasa por 3 pasos:

1 / convierte su archivo de ADN sin procesar AncestryDNA en formato 23andme usando un pequeño programa VBS que puede obtener desde aquí:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Simplemente tiene que ponerlo en el mismo directorio que su archivo de ADN descomprimido (archivo txt), haga doble clic y hará la conversión y cree un nuevo archivo en el mismo directorio llamado yourdnafilename_Edited.txt

2 / Instale este programa y cargue el archivo de ADN en formato 23andme en él:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(requiere .NET Framework 4.0, por lo que es posible que tenga que instalar primero t)

Vaya a Archivo -> Guardar y guárdelo en otro archivo de texto

3 / Copie el contenido de este archivo de texto en el área de texto de este sitio web y ejecute el predictor :

https://ytree.morleydna.com/

Debería obtener su Y-DNA haplogrupo ahora, que es el resultado etiquetado como «más probable». Si obtiene BT o F como «más probable» (la mayoría de la gente los tiene, por lo que es casi redundante), entonces la próxima predicción es la más probable (y relevante) para usted (debería haber más «verde» en ella que las otras opciones). Si tiene un problema o una pregunta, consulte el artículo vinculado anteriormente o pregúnteme. ¡Buena suerte!

Comentarios

• Chris Morley ha simplificado las cosas aún más. Simplemente cargue su archivo de datos sin procesar AncestryDNA (o MyHeritage o 23andMe) aquí ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal y obtenga el reenvío a su herramienta de predicción de haplogrupos.
• Usé ytree.morleydna.com con mi archivo de datos brutos AncestryDNA aproximadamente en 2014 y funcionó para mí. No ‘ no sé si aún puedes hacerlo hoy … Por cierto, el enlace de arriba ( genericgenealogist.net/2016/01/… ) ya no ‘ funciona para mí.)
• @TJinBC El enlace ha sido reaccionado

Tengo entendido que el producto AncestryDNA normal actual, que prueba el ADN autosómico, no incluir los SNP de ADN-Y o ADNmt que serían útiles para determinar su (s) haplogrupo (s).

Anteriormente, Ancestry vendía pruebas de ADN más caras para ADN-Y y ADNmt, pero ya no lo hace. FamilyTreeDNA, sin embargo:

https://www.familytreedna.com/

Usted » necesita descargar los datos sin procesar y descubrir el haplogrupo usted mismo usando la base de datos ISOGG:

https://isogg.org/tree/index.html

Comentarios

• AncestryDNA no ‘ no vende pruebas de Y-DNA y mtDNA. Solo FamilyTreeDNA lo hace.
• Por favor, especifique qué página del sitio web de ISOGG le dirá cómo averiguar el haplogrupo.
• Gracias @lkessler, yo ‘ he actualizado mi respuesta (¡me tomó bastante tiempo! Acabo de notar tus comentarios).

Llaman al cromosoma y «cromosoma 24».

Sin embargo, solo prueban 885 SNP.

También prueban 17,604 SNP en el cromosoma x (etiquetado como cromosoma 23), más 440 SNP etiquetados como cromosoma 25 que son ya sea del cromosoma X o de las regiones pseudoautosómicas del cromosoma Y.

Aún no conozco una herramienta para filtrar estas secciones y determinar haplogrupos, pero todavía estoy buscando.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Comentarios

• I ‘ nunca he visto el cromosoma Y llamado » cromosoma 24 «. Eso no tiene sentido porque hay 46 cromosomas, en 23 pares. Los primeros 22 pares de cromosomas se denominan cromosomas autosómicos. Los cromosomas X e Y (par 23) se denominan cromosomas sexuales.
• Creo que es un artefacto del formato de archivo AncestryDNA. Es el mismo csv o un archivo tabulado con datos brutos como ftdna o 23andme. Y es muy razonable escribir ChrX como Chr23 y ChrY como Chr24 (por ejemplo, el generador de archivos usa un tipo entero para el número / nombre de cromosomas)
• I Estoy totalmente seguro de que AncestryDNA designa ChrX como Chr23 porque existe tal conversión en utilidades útiles aquí: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Transferí mi prueba autosómica de Ancestry a este sitio y me dio mi grupo haplo que coincidió con la prueba Y que obtuve de National Geographic y FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry prueba suficientes SNP para obtener un haplogrupo de alto nivel. Las otras respuestas discutieron cómo obtener la Y y el método de Morley funciona bien PERO las mujeres no tienen una Y, por lo que el único haplogrupo que pueden obtener es el ADNmt (ADN mitocondrial).

Subiendo a Promethease.com que mostrará Los resultados de salud en su ADN pueden proporcionar un haplogrupo, pero no es fácil de usar y no tuve suerte con él.

Lo mejor es realizar la prueba en 23andme para obtener su haplogrupo de ADNmt de alto nivel o realizar la prueba detallada de ADNmt en familytreeDNA , probablemente esté a la venta justo antes del día de la madre.

Depende de la versión del chip AncestryDNA utilizada para genotipar su DNA, consulte el encabezado del archivo. El sitio SNPedia Haplogroup detalla lo que se sondea en las diferentes versiones del chip, y podría pasar muchas horas rastreando manualmente los ~ 1700 Y-DNA SNP en el archivo, para llamar a un Haplogrupo de alto nivel, alternativamente, puede obtener la misma respuesta arrojando $ 0- $ 12 a Promethease (dependiendo de la dirección del viento / capricho de la empresa), que también devolverá numerosos rasgos, como resistencia a plagas / sida, tolerancia a la lactosa, tolerancia al alcohol, color de ojos, tipo de cabello, … para las fichas de cerveza.