¿Qué hacer? es la opción correcta aquí.
El pronombre interrogativo se usa aquí como el objeto directo del infinitivo hacer . Un oyente hace la inserción necesaria: ¿Qué [hay] que hacer?
Al examinar la otra opción, uno ve que cómo es un adverbio interrogativo, pero como el solicitante pregunta qué hay que hacer, no cómo se debe hacer algo, esta opción no encaja aquí.
Tenga en cuenta que NINGUNA OPCIÓN ES UNA ORACIÓN COMPLETA.