バイオインフォマティクスに関するほとんどすべての論文で、ハイスループットという言葉に直面しましたが、説明が見つかりませんでした。それについて（私はそれがとても理解しやすいと思います、そしてそれは誰もがそれを説明する理由ですが、私はそれをすることができませんでした）。ハイスループットとはどういう意味か私に説明できる人はいますか？よろしくお願いします。
コメント
- 'は必ずしも生物学的な用語ではありません。 merriam-webster.com/dictionary/throughput
- Ha！つまり、スループットは「プットスルー」で逆になります！@canadianer
回答
ハイスループットシーケンシングとは、具体的には、イルミナのような、大量のDNA（数十万本のストランド）を一度にシーケンシングできるシーケンシング技術を指します。プラスミドにcDNAをクローニングした後、シーケンシングするなどの古い手法。
コメント
- ショットガンシーケンスはサンガーシーケンスプロトコルを使用します。
- はい、そうです。私はショットガンシーケンシングがハイスループットな方法であることを暗示していませんでした。 'それを反映するように回答を編集します
- 申し訳ありません。混乱しました。今すぐクリアします。しかし、それでもサンガーシーケンスは実際には低スループットではありません。それでもハイスループットですが、イルミナほど効率的ではありません。
- ありがとう、ロースループット技術の良い例は何でしょうか？
- PCR、ウエスタンブロット、ELISA、ブラッドフォードアッセイなどはすべて低スループットの手法です。
回答
カナディアンがコメントで示しているように、高スループットシステムによって処理されるデータの量を指します。 CactusWomanによる回答は、DNAシーケンスの場合には正しいでしょうが、ハイスループットは実際にはそのドメインに限定されていません。
ハイスループット手法は、複数の変数を同時に測定しようとします。例としては、次世代DNAシーケンス、RNAシーケンス、質量分析（LC-MS）によるタンパク質の同定と定量、GC-MSによる脂質プロファイリングなどがあります。
中スループット技術もあります。これはいくつかの変数を測定できますが、高スループットの手法よりはるかに少ないです。多くの低スループット技術は、ある程度の自動化と実験計画によって中スループットに変換できます。例には、リアルタイムPCRが含まれます。
回答
この用語のバイオインフォマティクスの使用については特に何もありません。専門用語ではなく、通常の英語です。 「スループット」とは、単に何かを処理できる速度を意味します。ハイスループットシステムは、物事を高速で処理するシステムであり、ゲノムシーケンス、都市交通ネットワーク、サッカーの試合の発券ゲート、ジャガイモをチップ（フライ）に加工する工場、またはプロセッサにも同様に適用できます。
生物学では、スループットとは通常、サンプルを処理できる速度を指します。したがって、「低」スループットの方法は、実行に時間がかかる可能性がある、少数のサンプルにしか適用できない、またはさまざまな要因の測定値の完全なセットを取得するために繰り返す必要がある方法です。 「高」スループット法は、単により高速な方法であり、同じ時間またはより短い時間でより多くのサンプルを処理することができます。これは、作業を高速化するか、複数のサンプルを一度に処理するか、同じサンプルの複数の側面を同時に処理することで実現できます。
何かが「高スループット」になる時期の定義はないことに注意してください。これは、以前の方法に比べて単純に「高い」ものですが、通常は、新しい方法が既存の方法よりも何倍も高速である場合にのみ適用され、わずかな段階的な改善は期待されません。
回答
ハイスループットシーケンシングとは、イルミナのような大量のDNAを一度にシーケンシングできるシーケンシング技術を指し、数十万の鎖を意味します。多数のデータシーケンスを同時に生成します。
コメント
- 参照を追加できますか？