AncestryDNAから結果を取得しました。
生のDNAデータからハプログループを見つける方法は何ですか?
回答
取得しましたこのリンクで詳しく説明されている最初の方法を使用した、AncestryDNA生DNAファイルからのY-DNAハプログループ: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html
要するに、3つのステップを経ます:
1 /ここから入手できる小さなVBSプログラムを使用して、AncestryDNA生のDNAファイルを23andme形式に変換します:
drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view
解凍したDNAファイル(txtファイル)と同じディレクトリに配置するだけで、ダブルクリックすると変換が行われます。 yourdnafilename_Edited.txtという名前の同じディレクトリに新しいファイルを作成します
2 /このプログラムをインストールし、23andme形式のdnaファイルをロードします:
drive.google.com/uc ?export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs
(。NET Framework 4.0が必要なため、そのファイルをインストールする必要がある場合がありますt)
[ファイル]-> [保存]に移動し、別のテキストファイルに保存します
3 /このテキストファイルの内容をこのWebサイトのテキスト領域にコピーし、予測子を実行します:
Y-DNAを取得する必要がありますhaplogroup now、これは「最も可能性が高い」というラベルの付いた結果です。 BTまたはFを「最も可能性が高い」と見なした場合(ほとんどの人がそれらを持っているため、ほとんど冗長です)、次の予測が最も可能性が高い(そして関連性があります)(より「グリーン」である必要があります)その他のオプション)問題や質問がある場合は、上記のリンク先の記事を参照するか、私に質問してください。頑張ってください!
コメント
- Chris Morleyは、物事をさらに簡素化しました。AncestryDNA(またはMyHeritageまたは23andMe)の生データファイルをここ ytree.morleydna.com/extractFromAutosine にロードして、転送してください彼のハプログループ予測ツールに。
- 2014年頃にAncestryDNA生データファイルでytree.morleydna.comを使用しましたが、うまくいきました。わからない'今日でもそれができるのなら…ところで、上のリンク( geneticgenealogist.net/2016/01/… )'はもう機能しません。)
- @TJinBCリンクは反応しました
回答
私の理解では、常染色体DNAをテストする現在の通常のAncestryDNA製品はそうではありません。ハプログループの決定に役立つY-DNAまたはmtDNASNPを含めます。
祖先は以前、Y-DNAおよびmtDNAのより高価なDNA検査を販売していましたが、現在は販売していません。ただし、FamilyTreeDNAは次のことを行います。
https://www.familytreedna.com/
あなた生データをダウンロードし、ISOGGのデータベースを使用して自分でハプログループを把握する必要があります:
https://isogg.org/tree/index.html
コメント
- AncestryDNAはY-DNAおよびmtDNAテストを販売していません'。 FamilyTreeDNAのみが行います。
- ISOGGWebサイトのどのページでハプログループを理解するかを指定してください。
- ありがとう@ lkessler、I '回答を更新しました(十分な時間がかかりました。コメントに気づきました)。
回答
彼らはy染色体を「染色体24」と呼んでいます。
しかし、彼らは885のSNPのみをテストします。
また、x染色体(染色体23としてラベル付け)で17,604のSNPをテストし、さらに染色体25としてラベル付けされた440のSNPをテストします。 X染色体またはY染色体の偽常染色体領域のいずれかから。
これらのセクションを除外してハプログループを決定するためのツールはまだわかりませんが、まだ検索中です。
http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart
コメント
- I ' "染色体24 "と呼ばれるY染色体を見たことがありません。46の染色体があるため、意味がありません。 23ペア。最初の22ペアの染色体は常染色体染色体と呼ばれます。XとY(ペア23)はセックス染色体と呼ばれます。
- AncestryDNAファイル形式のアーティファクトだと思います。同じです。 csvまたはftdnaや23andmeなどの生データを含む表形式のファイルが提供します。ChrXをChr23として、ChrYをChr24として記述することは非常に合理的です(たとえば、ファイルジェネレーターは染色体番号/命名に整数型を使用します)
- Iここの便利なユーティリティでそのような変換があるので、AncestryDNAがChrXをChr23として指定することを完全に確信しています: y-str.org/2014/09/autosine-dna-converter-nix。html
回答
Ancestry常染色体検査をこのサイトに転送したところ、 National Geographic and FamilyTreeのYテストに一致するハプログループ:
回答
Ancestryは、高レベルのハプログループを取得するのに十分なSNPをテストします。 YとMorleyの方法を取得することについて説明した他の回答はうまく機能しますが、女性はYを持っていないため、取得できるハプログループはmtDNA(ミトコンドリアDNA)だけです。
Promethease.comにアップロードすると表示されますあなたのDNAの健康結果はハプログループを提供することができますが、それは使いやすくなく、私はそれで運がありませんでした。
23andmeでテストして高レベルのmtDNAハプログループを取得するか、familytreeDNAで詳細なmtDNAテストを行うのが最善です、母の日の直前に発売される可能性があります。
回答
ジェノタイプに使用されるAncestryDNAチップのバージョンによって異なりますDNA、ファイルヘッダーを参照してください。 SNPedia Haplogroup サイトでは、さまざまなチップバージョンによってポーリングされた内容が詳しく説明されており、約1,700のY-DNAを手動で追跡するのに何時間も費やす可能性があります。ファイル内のSNPは、高レベルのハプログループを呼び出すために、または Promethease で$ 0〜 $ 12をスローすることで同じ答えを得ることができます(方向に応じて風/会社の気まぐれ)、これはまた、ペスト/エイズへの耐性、乳糖耐性、アルコール耐性、目の色、髪のタイプなど、ビールトークンの多くの特性を返します。