私は定量的遺伝学と G-（およびB-）について多くのことを読んでいます。マトリックス最近。私は今、分析を実行する背後にある原則を理解していますが、それをどのように実行するかはまだわかりません。 Rのダミー/古いデータを使って試してみて、どのように行われるかを確認したいと思います。
ショウジョウバエの5つの特性（翼の長さ、寿命、目の色素沈着、剛毛の数、およびフィットネス）。このデータから母集団のGマトリックスを作成し、Bマトリックスを取得して、特性の選択を測定できますか？
目的post：
1）G行列とB行列を作成するには、どのような情報（特性測定、フィットネススコアなど）が必要ですか？
2）この方法を実際に実装するためのガイドとなる印刷物またはオンライン資料を見つけたいと思います。 G行列は素晴らしいと言っている論文が非常に多いようですが、実際にそれらを実際に行う方法を誰も言っていません…
コメント
- あなたのリンクはG-matrixについてのみ話します。 ' Bマトリックスが何であるかわかりません。 Bマトリックスとは何かを説明するリンクはありますか？ Thks
- @ Remi.b b行列はg行列内のサブ行列です（g行列は4つのサブ行列で構成されています。Gm[男性の遺伝的分散と共分散]女性もGf、B （およびBが転置された）クロスセックスの遺伝的共分散
- G行列とは何かの簡単な説明は、この質問にあります。
回答
G行列を作成するには、すべての特性に対して加法的な遺伝的分散と共分散が必要です。通常、繁殖実験の結果（表現型の中間親子データなど）が必要であり、親子回帰を実行できます。適切なオンラインソースはわかりませんが、 Balding etalを参照してください。 .2007 p。534ffいくつかの情報。私は、G行列が無関係な個人の表現型データから直接推定できると主張する方法を見てきました（例： Zintzaras 2011 ）またはSNPなどのゲノム情報から（ Vattikuti etal。 2013 ）ですが、これらに精通しておらず、信頼性がどれほど信頼できるかわかりません。
混合モデルを使用してGマトリックスを推定する際の明確な背景（例/チュートリアルを含む）は、 Wilson et al（2009）にあります。
または、他に何か/より具体的なことを考えていましたか？
コメント
- これには、私が推測する2つの側面があります。まず、'その方法を知りたいです。次に、ショウジョウバエのヘミクローナル系統からの形質値を使用して、各ハプロタイプの性別固有の形質値を取得し、Bマトリックスを作成できるかどうかを判断しようとしています。
- そうですね、ヘミクローナルラインから遺伝的差異を取得することができます-それらを計算する方法とキャプチャされた遺伝率の量を正確に考慮する必要があります。どういう意味ですか：" まず、'その方法を知りたいです "。行列には何が含まれていますか、回帰を技術的に実行する方法などはありますか？あなたはもっと具体的なことを求めているのではないかと思いましたが、質問を更新してわかりにくくする必要があります。
- また、動物モデル（統計的混合モデル）を見たことがありますか？血統全体を使用してGマトリックスの構成要素を推定できるのはどこですか？
- "どのようにそれらを実行できるか"は、質問ですでに述べているように、どのような種類のデータが必要で、何を測定する必要があるかです。
- @GriffinEvoこれは私には不明確なことだと思います。単純なケースでは、Gマトリックスに必要なのは、関心のある特性と個人間の既知の関係（親子など）に関する表現型データです。私もこれを私の答えに書いたが、どうやらあなたは何か他のものを探しているようだ。例えばを説明するために環境要因、性別、または既知の血統には、より複雑な統計モデルが必要です。 動物モデル。役に立つかもしれない論文で答えを更新しました。