생물 정보학에 관한 거의 모든 논문에서 처리량이 높은 단어에 직면했지만 설명을 찾을 수 없습니다. 그것에 대해 (이해하기가 너무 쉽다고 생각합니다. 그래서 누구든지 설명을했지만 할 수 없었습니다.). 처리량이 많다는 것이 무엇을 의미하는지 설명 해줄 수있는 사람이 있습니까? 미리 감사드립니다.
댓글
- ' 반드시 생물학적 용어는 아닙니다. merriam-webster.com/dictionary/throughput
- 하! 따라서 처리량은 “통과”로 반전됩니다. @canadianer
Answer
High-throughput sequencing은 특히 Illumina와 같은 시퀀싱 기술을 의미합니다.이 기술을 사용하면 한 번에 대량의 DNA (수십만 가닥)를 시퀀싱 할 수 있습니다. 플라스미드에서 cDNA를 복제 한 다음 시퀀싱과 같은 오래된 기술.
댓글
- Shotgun 시퀀싱은 Sanger 시퀀싱 프로토콜을 사용합니다.
- 예, 그렇습니다. 나는 샷건 시퀀싱이 높은 처리량 방법이라는 것을 암시하지 않았습니다. '이를 반영하도록 답변을 수정하겠습니다.
- 죄송합니다. 나는 혼란 스러웠다. 지금 삭제하세요. 그러나 여전히 Sanger 시퀀싱은 실제로 낮은 처리량은 아닙니다. 여전히 높은 처리량이지만 Illumina만큼 효율적이지는 않습니다.
- 감사합니다. 그러면 낮은 처리량 기술의 좋은 예는 무엇일까요?
- PCR, 웨스턴 블롯, ELISA, Bradford 분석 등은 모두 처리량이 적은 기술입니다.
답변
높은 처리량 (캐나다 사람의 의견에 표시됨) 시스템에서 처리하는 데이터의 양을 나타냅니다. CactusWoman의 대답은 DNA 염기 서열 분석의 경우에 맞지만, 높은 처리량은 실제로 해당 영역에 국한되지 않습니다.
고 처리량 기술은 여러 변수를 동시에 측정하려고합니다. 예를 들면 Next Gen DNA 시퀀싱 외에 RNA 시퀀싱, 단백질 식별 및 질량 분석법 (LC-MS)에 의한 정량화, GC-MS에 의한 지질 프로파일 링 등이 있습니다.
중간 처리량 기술도 있습니다. 여러 변수를 측정 할 수 있지만 처리량이 많은 기술보다는 훨씬 적습니다. 많은 저 처리량 기술은 일정 수준의 자동화 및 실험 계획을 통해 중간 처리량으로 변환 할 수 있습니다. 예를 들면 실시간 PCR이 있습니다.
답변
이 용어의 생물 정보 학적 사용에 대해 특별한 것은 없습니다. 전문 용어가 아닌 일반 영어입니다. “처리량”은 단순히 무언가가 처리 될 수있는 속도를 의미합니다. 높은 처리량 시스템은 빠른 속도로 사물을 처리하는 시스템이며 게놈 시퀀싱, 도시 교통 네트워크, 축구 경기의 티켓팅 게이트, 감자를 칩으로 가공하는 공장 (튀김) 또는 프로세서에 동일하게 적용될 수 있습니다. 그러나 생물학에서 처리량은 일반적으로 샘플을 처리 할 수있는 속도를 나타냅니다. 따라서 “낮은”처리량 방법은 수행하는 데 시간이 더 오래 걸리거나, 몇 개의 샘플에만 적용 할 수 있거나, 다른 요인의 전체 측정 세트를 얻기 위해 반복해야하는 방법입니다. “높은”처리량 방법은 더 빠른 방법으로, 더 많은 수의 샘플을 동일하거나 더 짧은 시간에 처리 할 수 있습니다. 이는 더 빠르게 작업하거나 한 번에 여러 샘플을 처리하거나 동일한 샘플의 여러 측면을 동시에 처리하여 달성 할 수 있습니다.
무엇이 “높은 처리량”이되는시기에 대한 정의는 없습니다. 일반적으로 새 방법이 기존 방법보다 몇 배 더 빠를 때만 적용될 것으로 예상 할 수 있지만 작은 점진적 개선이 아니라 단순히 이전 방법에 비해 “높음”입니다.
Answer
고 처리량 시퀀싱은 특히 대량의 DNA를 한 번에 시퀀싱 할 수있는 Illumina와 같은 시퀀싱 기술을 의미하며 수십만 가닥을 의미합니다. 다수의 데이터 시퀀스를 동시에 생성합니다.
댓글
- 참조를 추가 할 수 있습니까?