Encontrando haplogrupo por meio de dados brutos de DNA?

Eu obtive meu haplogrupo Y-DNA de meu arquivo de DNA bruto AncestryDNA usando o primeiro método detalhado neste link: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

Resumindo, ele passa por 3 etapas:

1 / você converte seu arquivo de DNA bruto do AncestryDNA para o formato 23andme usando um pequeno programa VBS que você pode obter aqui:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Você simplesmente tem que colocá-lo no mesmo diretório que seu arquivo DNA descompactado (arquivo txt), clique duas vezes e ele fará a conversão e crie um novo arquivo no mesmo diretório chamado yourdnafilename_Edited.txt

2 / Você instala este programa e carrega nele o arquivo dna de formato 23andme:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(requer .NET Framework 4.0, então você pode ter que instalar o primeiro t)

Vá para Arquivo -> Salvar e salve em outro arquivo de texto

3 / Copie o conteúdo deste arquivo de texto para a área de texto deste site e execute o preditor :

https://ytree.morleydna.com/

Você deve obter o seu Y-DNA haplogrupo agora, que é o resultado rotulado como “mais provável”. Se você pegar BT ou F como “mais provável” (a maioria das pessoas tem, então é quase redundante), então a próxima previsão é a mais provável (e relevante) para você (deve haver mais “verde” nela do que as outras opções). Se você tiver um problema ou dúvida, consulte o artigo no link acima ou me pergunte. Boa sorte!

Comentários

• Chris Morley simplificou ainda mais as coisas. Basta carregar seu arquivo de dados brutos AncestryDNA (ou MyHeritage ou 23andMe) aqui ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal e ser encaminhado para sua ferramenta de previsão de haplogrupo.
• Usei ytree.morleydna.com com meu arquivo de dados brutos AncestryDNA por volta de 2014 e funcionou para mim. Não ‘ não sei se você ainda pudesse fazer isso hoje … BTW, o link acima ( geneticgenealogist.net/2016/01/… ) não ‘ não funciona mais para mim.)
• @TJinBC O link foi reativo vated.

Meu entendimento é que o produto AncestryDNA normal atual, que testa DNA autossômico, não inclua os SNPs de Y-DNA ou mtDNA que seriam úteis para determinar seu (s) haplogrupo (s).

A Ancestry vendia anteriormente testes de DNA mais caros para Y-DNA e mtDNA, mas não vendem mais. FamilyTreeDNA, no entanto:

https://www.familytreedna.com/

Você “ll precisa baixar os dados brutos e descobrir o haplogrupo sozinho usando o banco de dados ISOGG “:

https://isogg.org/tree/index.html

Comentários

• O AncestryDNA não ‘ vende testes de Y-DNA e mtDNA. Apenas FamilyTreeDNA o faz.
• Especifique qual página do site ISOGG dirá como descobrir o haplogrupo.
• Obrigado @lkessler, I ‘ atualizei minha resposta (demorei bastante! acabei de notar seus comentários).

Eles chamam o cromossomo y de “cromossomo 24”.

Eles testam apenas 885 SNP “s.

Eles também testam 17.604 SNP” s no cromossomo x (rotulado como cromossomo 23), além de 440 SNPs rotulados como cromossomo 25 que são tanto do cromossomo X quanto das regiões pseudoautossômicas do cromossomo Y.

Não conheço uma ferramenta, ainda, para filtrar essas seções para determinar haplogrupos, mas ainda estou procurando.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Comentários

• I ‘ nunca vi o cromossomo Y chamado ” cromossomo 24 “. Isso não faz sentido porque existem 46 cromossomos, em 23 pares. Os primeiros 22 pares de cromossomos são chamados de cromossomos autossômicos. O X e Y (par 23) são chamados de cromossomos sexuais.
• Acho que é um artefato do formato de arquivo AncestryDNA. É o mesmo csv ou arquivo tabulado com dados brutos como ftdna ou 23andme fornecidos. E é muito razoável escrever ChrX como Chr23 e ChrY como Chr24 (por exemplo, o gerador de arquivo usa tipo inteiro para número / nomenclatura do cromossomo)
• I estou totalmente certo de que AncestryDNA designa ChrX como Chr23 porque existe essa conversão em utilitários úteis aqui: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Transferi meu teste autossômico Ancestry para este site e ele me deu meu grupo haplo que correspondeu ao teste Y que fiz na National Geographic e FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestrais testa SNPs suficientes para obter um haplogrupo de alto nível. As outras respostas discutidas com a obtenção do Y e o método de Morley funcionam bem, MAS as mulheres não têm um Y, então o único haplogrupo que podem obter é o mtDNA (DNA mitocondrial).

Enviando para Promethease.com, que mostrará resultados de saúde em seu DNA podem fornecer um haplogrupo, mas não é fácil de usar e não tive sorte com isso.

Melhor testar no 23andme para obter seu haplogrupo de mtDNA de alto nível ou fazer o teste detalhado de mtDNA em familytreeDNA , provavelmente à venda antes do dia das mães.

Depende da versão do chip AncestryDNA usado para genotipar seu DNA, veja o cabeçalho do arquivo. O site do SNPedia Haplogroup detalha o que é pesquisado pelas diferentes versões do chip, e você poderia gastar muitas horas manualmente rastreando o ~ 1.700 Y-DNA SNPs no arquivo, para chamar um Haplogrupo de alto nível, como alternativa, você pode obter a mesma resposta jogando $ 0- $ 12 em Promethease (dependendo da direção do vento / capricho da empresa), que também retornará inúmeros traços, como resistência à praga / sida, tolerância à lactose, tolerância ao álcool, cor dos olhos, tipo de cabelo, … para os tokens de cerveja.