Právě jsem získal výsledky z AncestryDNA.
Jaké jsou způsoby, jak najít svou haploskupinu pomocí mých surových dat DNA?
Odpověď
Získal jsem moje haploskupina Y-DNA z mého surového souboru DNA AncestryDNA pomocí první metody popsané v tomto odkazu: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html
Stručně řečeno, prochází 3 kroky:
1 / převedete svůj surový soubor DNA AncestryDNA do formátu 23andme pomocí malého programu VBS, který můžete získat zde:
drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view
Musíte jej jednoduše umístit do stejného adresáře jako váš rozbalený soubor DNA (soubor txt), dvakrát na něj kliknout a provede konverzi a vytvořte nový soubor ve stejném adresáři s názvem yourdnafilename_Edited.txt
2 / Nainstalujete tento program a načtete do něj soubor dna ve formátu 23andme:
drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs
(vyžaduje .NET Framework 4.0, takže možná budete muset tyto jedle nainstalovat t)
Přejít na Soubor -> Uložit a uložit do jiného textového souboru
3 / Zkopírujte obsah tohoto textového souboru do textové oblasti na tomto webu a spusťte prediktor :
Měli byste si pořídit Y-DNA haploskupina, což je výsledek označený jako „nejpravděpodobnější“. Pokud dostanete BT nebo F jako „nejpravděpodobnější“ (většina lidí je má, takže je to téměř nadbytečné), pak je pro vás nejpravděpodobnější (a nejrelevantnější) další předpověď (mělo by v ní být více „zelené“ než další možnosti). Pokud máte problém nebo otázku, podívejte se na výše uvedený článek nebo se mě zeptejte. Hodně štěstí!
Komentáře
- Chris Morley to ještě více zjednodušil. Stačí sem načíst svůj nezpracovaný datový soubor AncestryDNA (nebo MyHeritage nebo 23andMe) ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal a přeposlat k jeho nástroji pro predikci haploskupin.
- Použil jsem ytree.morleydna.com s mým surovým datovým souborem AncestryDNA asi v roce 2014 a fungovalo to pro mě. ‚ nevím pokud to dnes ještě zvládnete … BTW, výše uvedený odkaz ( genetickýgenealogist.net/2016/01/… ) již pro mě ‚ nefunguje.)
- @TJinBC Odkaz byl reaktivní vated.
Odpověď
Chápu, že současný normální produkt AncestryDNA, který testuje Autosomální DNA, zahrňte SNP Y-DNA nebo mtDNA, které by byly užitečné pro stanovení vašich haploskupin.
Předci dříve prodávali dražší testy DNA pro Y-DNA a mtDNA, ale již to neudělají. FamilyTreeDNA to však dělá:
https://www.familytreedna.com/
Vy budete je třeba stáhnout nezpracovaná data a zjistit haploskupinu pomocí databáze ISOGG:
https://isogg.org/tree/index.html
Komentáře
- AncestryDNA neprodává ‚ testy Y-DNA a mtDNA. Pouze FamilyTreeDNA ano.
- Určete, která stránka na webu ISOGG vám řekne, jak přijít na haploskupinu.
- Díky @lkessler, ‚ aktualizoval jsem svou odpověď (trvalo mi to dost dlouho, jen jsem si všiml vašich komentářů).
Odpověď
Nazývají chromozom y „chromozom 24“.
Testují však pouze 885 SNP.
Testují také 17 604 SNP na chromozomu x (označeném jako chromozom 23) plus 440 SNP označených jako chromozom 25, které jsou buď z chromozomu X nebo z pseudoautozomálních oblastí chromozomu Y.
Zatím neznám nástroj pro filtrování těchto sekcí k určení haploskupin, ale stále hledám.
http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart
Komentáře
- I ‚ Nikdy jsem neviděl chromozom Y s názvem “ chromozom 24 „. To nedává smysl, protože v 46 chromozomech je 23 párů. Prvních 22 párů chromozomů se nazývá Autosomální chromozomy. X a Y (pár 23) se nazývají Sex chromozomy.
- Myslím, že jde o artefakt formátu souboru AncestryDNA. Je to stejné csv nebo tabulkový soubor se surovými daty, jako je ftdna nebo 23andme provide. A je velmi rozumné psát ChrX jako Chr23 a ChrY jako Chr24 (například generátor souborů používá pro číslo / pojmenování chromozomu celočíselný typ)
- I Jsem si naprosto jistý, že AncestryDNA označuje ChrX jako Chr23, protože zde existuje takový převod užitečných nástrojů: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html
Odpověď
Na svůj web jsem přenesl svůj autosomální test Ancestry a dal mi haplo skupina, která odpovídala testu Y, který jsem měl od National Geographic a FamilyTree:
Odpověď
Předky testují dostatek SNP, aby získaly haploskupinu na vysoké úrovni. Ostatní diskutované odpovědi týkající se získání metody Y a Morley fungují dobře, ALE ženy nemají Y, takže jedinou haploskupinou, kterou mohou získat, je mtDNA (mitochondriální DNA).
Nahrávání na Promethease.com, které ukáže zdravotní výsledky ve vaší DNA mohou poskytnout haploskupinu, ale její použití není snadné a neměl jsem s ní štěstí.
Nejlepší je otestovat ve 23 a získat svoji vysokou úroveň mtDNA haploskupiny nebo si udělat podrobný test mtDNA na rodinném stromě , pravděpodobně bude v prodeji těsně před dnem matky.
Odpověď
Závisí na verzi čipu AncestryDNA použitém pro Genotype vašeho DNA, viz záhlaví souboru. Stránka SNPedia Haplogroup podrobně popisuje, co dotázali různé verze čipů, a mnoho hodin byste mohli strávit manuálním sledováním ~ 1700 Y-DNA SNP v souboru, chcete-li volat haploskupinu na vysoké úrovni, alternativně můžete získat stejnou odpověď házením $ 0- $ 12 na Promethease (v závislosti na směru vítr / rozmar společnosti), který také vrátí četné vlastnosti, například odolnost vůči moru / aids, toleranci laktózy, toleranci alkoholu, barvu očí, typ vlasů, … pro pivní žetony.