Comment pouvons-nous dessiner des projections de Fischer pour un à cinq composés de carbone?

Par exemple, disons que nous avons du pentane-2,3, 4-triol ($ \ ce {CH3-CHOH-CHOH-CHOH-CH3} $; image ci-dessous). Avec la structure en coin et en tableau de bord, le groupe alcool est en dessous du plan pour les 2ème et 4ème carbones mais au-dessus pour le 3ème carbone. Comment dessiner la projection de Fischer de ce composé?

pentane-2,3,4-triol

Jai lu un extrait du chapitre sur les glucides dans le livre de Salomon (10e édition) mais je nai compris que partiellement comment dessiner des projections de Fischer car il est donné très brièvement. Aussi, un bref Lintroduction est donnée dans le chapitre 5 mais elle concerne uniquement les composés à deux carbones.

Jai beaucoup essayé mais je ne comprends pas comment le construire ou quelles sont les conventions sur lesquelles ils sont faits. Apparemment, le web ne décrit pas les projections de Fischer de manière très détaillée probablement parce quelles ne sont généralement utilisées quen biochimie.

Commentaires

  • Cette vidéo est assez informative à mon avis.
  • Merci pour le lien, cest bien pour expliquer une conversion de centre de chiralité. Mais cela nexplique pas ' plus de trois centres de chiralité. De même, sur le Web, personne n’a expliqué plus de trois centres de chiralité de manière très élaborée.
  • @Resorcinol Veuillez ne pas utiliser \ce{...} pour quelque chose qui nest pas un produit chimique. Il peut avoir des effets secondaires indésirables comme vous auriez dû le voir dans laperçu dédition. Veuillez également utiliser laperçu des modifications pour vérifier la fin de vos modifications. Vous pouvez voir à quoi ressemblait le message ici . Enfin, le balisage des guillemets doit être réservé aux citations.

Réponse

Les premières choses à noter lors du dessin de projections Fischer sont les règles générales pour les dessiner. La première règle générale concerne les choix de «haut» et «bas» tandis que la seconde concerne la façon dont chaque croix est interprétée.

  1. Dans une projection de Fischer, latome de carbone avec loxydation la plus élevée Létat doit être plus proche du haut que du bas.

    Dans les cas où létat doxydation le plus élevé est au centre ou lorsque plusieurs carbones ont le même état doxydation le plus élevé, le deuxième plus élevé sapplique de manière analogue et ainsi de suite.

  2. Dans une projection Fischer, les liaisons verticales sont toujours considérées comme pointant derrière le plan papier (ou écran) (hachage) tandis que les liaisons horizontales sont considérées pour pointer devant (coin).

    Ceci est illustré dans la figure 1.

Définition de la stéréochimie dans les projections de Fischer
Figure 1: Comment les informations stéréochimiques sont encodées dans les projections de Fischer.

Votre composition présente un pro blem selon ces règles car il ny a pas de carbone le plus oxydé. Au contraire, les trois carbones 2, 3 et 4 sont à létat doxydation $ \ pm 0 $ tandis que les deux terminaux sont tous les deux $ \ mathrm {-III} $ . Pour atténuer cette limitation, je vais discuter de la projection de Fischer avec la molécule associée montrée dans la figure 2, qui a un carbone terminal oxydé en un acide carboxylique rompant le lien.

Acide L-5-désoxyribonique
Figure 2: acide L-5-désoxyribonique; une molécule de remplacement avec la même stéréochimie sur les groupes hydroxy centraux.

Pour cette molécule, il est clair que lacide doit être mis au-dessus. En descendant chaque liaison, nous devons les faire pivoter jusquà ce que nous ayons la chaîne la plus longue en position verticale et pointée vers larrière (cf. figure 1). Je vais vous laisser utiliser un kit de modélisation, un stylo et du papier ou votre visualisation 3D pour effectuer les transformations réelles; le produit final avec lequel vous devriez vous retrouver est le suivant dans la figure 3.

Projection de Fischer de L-5-désoxyribonique acide
Figure 3: Projection de Fischer de la molécule de la figure 2.

Il devrait y avoir peu de débats sur lacide carboxylique; et que le groupe carbonyle ou le groupe hydroxy de celui-ci pointe vers la gauche na pas dimportance; nous pouvons tourner autour de la liaison $ \ ce {C {1} -C {2}} $ . Pour voir lorientation correcte de $ \ ce {C {2}} $ et $ \ ce {C {4}} $ , vous pouvez prendre la formule squelettique de la figure 2 et regarder den haut; pour $ \ ce {C {3}} $ vous devriez regarder den bas.Nous constatons que tous les groupes hydroxy pointent dans la même direction; ici: à gauche. Cela signifie que ma molécule peut être considérée comme un dérivé du ribose; et comme le groupe hydroxy du carbone asymétrique le plus bas pointe vers la gauche, il dérive du L-ribose.

Revenez à votre molécule. Non seulement la désignation est ambiguë (voir ci-dessus sur létat doxydation le plus élevé) mais elle est également $ C_ \ mathrm {s} $ symétrique, cest-à-dire achiral. Jai dessiné votre molécule avec son plan de symétrie (en pointillés) sur la figure 4.

pentane-2,3 , 4-triol; 1,5-didésoxyribitol
Figure 4: La molécule dorigine en question; 1,5-didésoxyribitol ou (2 R , 3 s , 4 S ) -pentane-2,3,4-triol.

Nous devons choisir arbitrairement un carbone «top» ici. Pour des raisons de cohérence, choisissons celui de gauche qui était un acide dans l’ancienne structure (figure 2). Cela signifie que nous avons un travail très facile de dessiner la projection Fischer comme nous lavons déjà fait. Elle est illustrée à la figure 5.

Projection de Fischer de 1,5-didésoxyribitol
Figure 5: Projection de Fischer du triol illustré à la figure 4.

Nous pouvons être tenté dassigner une configuration en L immédiatement mais rappelez-vous que nous avons réalisé que la molécule devait avoir un plan de symétrie. Eh bien, cest également le cas dans la projection Fischer; le plan est horizontal et renferme les liaisons $ \ ce {HO-C-H} $ de latome de carbone central. On peut aussi tourner autour de notre feuille de papier ou écran de PC et se rendre compte que lon peut ainsi ladapter parfaitement à son image miroir, représentée sur la figure 5 à droite du plan miroir en pointillé. Ainsi, nous avons montré à deux reprises que votre molécule est achirale, quun groupe hydroxy pointant vers la gauche et vers la droite sur le carbone asymétrique le plus bas est possible et que par conséquent attribuer un stéréodescripteur D / L na pas de sens.

Commentaires

  • Mais selon dautres sources, latome de carbone qui est donné numéro un selon la nomenclature IUPAC est placé en haut et non celui avec létat doxydation le plus élevé. Vous avez également dit que lacide carboxylique devrait être en haut, il est également numéroté un mais il a le même état doxydation de III que celui du méthyle terminal?
  • Merci beaucoup jan pour votre réponse. Pouvez-vous expliquer comment pouvons-nous faire pivoter les liaisons jusquà ce que la chaîne la plus profonde soit en position verticale? Quelle est la signification de toutes les liaisons pointant vers larrière?
  • Aussi pourquoi pour c3 nous regardons den bas et pour les autres den haut?
  • @RaghavSingal Je ne sais pas si cest létat doxydation ou celui numéroté comme numéro un. Je devrais le découvrir. Notez que les états doxydation sont signés, donc $ \ mathrm {-III < + I < + III} $
  • @RaghavSingal Dessiner les rotations sur papier est assez difficile à faire et cela devrait vous être plus avantageux si vous essayez vous-même.

Laisser un commentaire

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée. Les champs obligatoires sont indiqués avec *