Trouver un haplogroupe grâce à des données ADN brutes?

Jai obtenu mon haplogroupe Y-DNA à partir de mon fichier ADN brut AncestryDNA en utilisant la première méthode détaillée dans ce lien: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

En bref, il passe par 3 étapes:

1 / vous convertissez votre fichier ADN brut dAncestryDNA au format 23andme à laide dun petit programme VBS que vous pouvez obtenir ici:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Il vous suffit de le mettre dans le même répertoire que votre fichier DNA décompressé (fichier txt), double-cliquez, et il effectuera la conversion et créez un nouveau fichier dans le même répertoire nommé yourdnafilename_Edited.txt

2 / Vous installez ce programme et y chargez le fichier ADN au format 23andme:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(il nécessite .NET Framework 4.0, vous devrez donc peut-être installer ce premier t)

Allez dans Fichier -> Enregistrer, et enregistrez-le dans un autre fichier texte

3 / Copiez le contenu de ce fichier texte dans la zone de texte de ce site, et exécutez le prédicteur :

https://ytree.morleydna.com/

Vous devriez obtenir votre ADN-Y haplogroupe maintenant, qui est le résultat étiqueté «le plus probable». Si vous obtenez BT ou F comme « le plus probable » (la plupart des gens en ont, donc cest presque redondant), alors la prochaine prédiction est la plus probable (et pertinente) pour vous (il devrait y avoir plus de « vert » dedans que les autres options). Si vous avez un problème ou une question, référez-vous à larticle ci-dessus ou demandez-moi. Bonne chance!

Commentaires

• Chris Morley a encore simplifié les choses. Il vous suffit de charger votre fichier de données brutes AncestryDNA (ou MyHeritage ou 23andMe) ici ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal et être transféré à son outil de prédiction dhaplogroupe.
• Jai utilisé ytree.morleydna.com avec mon fichier de données brutes AncestryDNA vers 2014 et cela a fonctionné pour moi. Don ‘ ne sais pas si vous pouviez encore le faire aujourdhui … BTW, le lien ci-dessus ( geneealogist.net/2016/01/… ) ‘ ne fonctionne plus pour moi.)
• @TJinBC Le lien a été réacti vated.

Je crois comprendre que le produit AncestryDNA normal actuel, qui teste lADN autosomique, ne incluez les SNP de lADN-Y ou de lADNmt qui seraient utiles pour déterminer votre ou vos haplogroupes.

Ancestry vendait auparavant des tests ADN plus chers pour lADN-Y et lADNmt, mais ce nest plus le cas. Cependant, FamilyTreeDNA:

https://www.familytreedna.com/

Vous « ll besoin de télécharger les données brutes et de déterminer vous-même lhaplogroupe à laide de la base de données ISOGG:

https://isogg.org/tree/index.html

Commentaires

• AncestryDNA ne vend pas ‘ des tests ADN-Y et ADNmt. Seul FamilyTreeDNA le fait.
• Veuillez spécifier quelle page du site Web dISOGG vous indiquera comment déterminer lhaplogroupe.
• Merci @lkessler, je ‘ a mis à jour ma réponse (cela ma pris assez de temps! je viens de remarquer vos commentaires).

Ils appellent le chromosome y « chromosome 24 ».

Ils ne testent que 885 SNP.

Ils testent également 17 604 SNP sur le chromosome x (étiqueté comme chromosome 23), plus 440 SNP étiquetés comme chromosome 25 qui sont soit du chromosome X, soit des régions pseudo-autosomiques du chromosome Y.

Je ne connais pas encore doutil pour filtrer ces sections afin de déterminer les haplogroupes mais je suis toujours en train de chercher.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Commentaires

• I ‘ je nai jamais vu le chromosome Y appelé  » chromosome 24 « . Cela na aucun sens car il y a 46 chromosomes dans 23 paires. Les 22 premières paires de chromosomes sont appelées les chromosomes autosomiques. Le X et Y (paire 23) sont appelés les chromosomes sexuels.
• Je pense que cest un artefact du format de fichier AncestryDNA. Cest la même chose csv ou fichier tabulé avec des données brutes comme ftdna ou 23andme fournissent. Et il est très raisonnable décrire ChrX comme Chr23 et ChrY comme Chr24 (par exemple, le générateur de fichiers utilise le type entier pour le numéro / dénomination des chromosomes)
• I Je suis tout à fait sûr quAncestryDNA désigne ChrX comme Chr23 car il existe une telle conversion dans des utilitaires utiles ici: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Jai transféré mon test autosomique dAncestry sur ce site et il ma donné mon groupe haplo qui correspondait au test Y que javais de National Geographic et FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry teste suffisamment de SNP pour obtenir un haplogroupe de haut niveau. Les autres réponses discutées pour obtenir le Y et la méthode Morley fonctionnent bien MAIS les femmes nont pas de Y donc le seul haplogroupe quelles peuvent obtenir est lADNmt (ADN mitochondrial).

Téléchargement sur Promethease.com qui montrera les résultats de santé dans votre ADN peuvent fournir un haplogroupe mais ce nest pas facile à utiliser et je nai pas eu de chance avec lui.

Il est préférable de tester à 23andme pour obtenir votre haplogroupe dADNmt de haut niveau ou de faire le test dADNmt détaillé sur familytreeDNA , probablement en vente juste avant la fête des mères.

Dépend de la version de la puce AncestryDNA utilisée pour génotyper votre DNA, voir len-tête du fichier. Le site SNPedia Haplogroup détaille ce qui a été interrogé par les différentes versions de puces, et vous pourriez passer de nombreuses heures à suivre manuellement les ~ 1 700 ADN-Y SNP dans le fichier, pour appeler un haplogroupe de haut niveau, vous pouvez également obtenir la même réponse en lançant de 0 $ à 12 $ à Promethease (en fonction de la direction du vent / caprice de lentreprise), qui rendra également de nombreux traits, comme la résistance à la peste / au sida, la tolérance au lactose, la tolérance à lalcool, la couleur des yeux, le type de cheveux, … pour les jetons de bière.