Trovare laplogruppo attraverso i dati grezzi del DNA?

Ho ottenuto il mio aplogruppo Y-DNA dal mio file DNA grezzo AncestryDNA utilizzando il primo metodo descritto in questo link: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

In breve, passa attraverso 3 passaggi:

1 / converti il tuo file DNA grezzo di AncestryDNA in formato 23andme utilizzando un piccolo programma VBS che puoi ottenere da qui:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Devi semplicemente metterlo nella stessa directory del tuo file DNA decompresso (file txt), fare doppio clic e farà la conversione e crea un nuovo file nella stessa directory denominata yourdnafilename_Edited.txt

2 / Installa questo programma e carichi il file dna in formato 23andme al suo interno:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(richiede .NET Framework 4.0, quindi potrebbe essere necessario installarlo per primo t)

Vai su File -> Salva e salva in un altro file di testo

3 / Copia il contenuto di questo file di testo nellarea di testo su questo sito web ed esegui il predittore :

https://ytree.morleydna.com/

Dovresti ottenere il tuo Y-DNA aplogruppo ora, che è il risultato etichettato come “molto probabile”. Se ottieni BT o F come “molto probabile” (la maggior parte delle persone li ha, quindi è quasi ridondante), la previsione successiva è la più probabile (e pertinente) per te (dovrebbe esserci più “verde” di le altre opzioni). Se hai un problema o una domanda, fai riferimento allarticolo collegato sopra, oppure chiedi a me. Buona fortuna!

Commenti

• Chris Morley ha semplificato ulteriormente le cose. Carica il tuo file di dati grezzi AncestryDNA (o MyHeritage o 23andMe) qui ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal e sarai inoltrato al suo strumento di previsione dellaplogruppo.
• Ho usato ytree.morleydna.com con il mio file di dati grezzi AncestryDNA nel 2014 e per me ha funzionato. Non ‘ lo so se ancora potessi farlo oggi … A proposito, il link sopra ( genetgenealogist.net/2016/01/… ) ‘ non funziona più per me.)
• @TJinBC Il collegamento è stato reagito vated.

La mia comprensione è che lattuale normale prodotto AncestryDNA, che testa il DNA autosomico, non includere gli SNP Y-DNA o mtDNA che sarebbero utili per determinare il tuo aplogruppo.

Ancestry in precedenza vendeva test del DNA più costosi per Y-DNA e mtDNA, ma non lo fa più. FamilyTreeDNA, tuttavia:

https://www.familytreedna.com/

Tu “ll è necessario scaricare i dati grezzi e capire da soli laplogruppo utilizzando il database di ISOGG:

https://isogg.org/tree/index.html

Commenti

• AncestryDNA ‘ non vende test Y-DNA e mtDNA. Solo FamilyTreeDNA lo fa.
• Per favore specifica quale pagina del sito web ISOGG ti dirà come capire laplogruppo.
• Grazie @lkessler, I ‘ ho aggiornato la mia risposta (mi ci è voluto abbastanza tempo! Ho appena notato i tuoi commenti).

Chiamano il cromosoma y “cromosoma 24”.

Testano solo 885 SNP “però.

Testano anche 17.604 SNP” s sul cromosoma x (etichettato come cromosoma 23), più 440 SNP etichettati come cromosoma 25 che sono sia dal cromosoma X che dalle regioni pseudoautosomiche del cromosoma Y.

Non conosco ancora uno strumento per filtrare queste sezioni per determinare gli aplogruppi, ma sto ancora cercando.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Commenti

• I ‘ non ho mai visto il cromosoma Y chiamato ” cromosoma 24 “. Non ha senso perché ci sono 46 cromosomi, in 23 coppie. Le prime 22 coppie di cromosomi sono chiamate cromosomi autosomici. X e Y (coppia 23) sono chiamate cromosomi sessuali.
• Penso che sia un artefatto del formato di file AncestryDNA. È lo stesso csv o un file tabulato con dati grezzi come ftdna o 23andme forniscono. Ed è molto ragionevole scrivere ChrX come Chr23 e ChrY come Chr24 (ad esempio, il generatore di file utilizza il tipo intero per il numero / denominazione del cromosoma)
• I Sono assolutamente sicuro che AncestryDNA designi ChrX come Chr23 perché esiste tale conversione in utilità utili qui: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Ho trasferito il mio test autosomico Ancestry su questo sito e mi ha dato il mio gruppo haplo che corrisponde al test Y che ho ricevuto da National Geographic e FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry verifica abbastanza SNP per ottenere un aplogruppo di alto livello. Le altre risposte discusse come ottenere la Y e il metodo Morley funzionano bene MA le donne non hanno una Y quindi lunico aplogruppo che possono ottenere è il mtDNA (DNA mitocondriale).

Caricamento su Promethease.com che mostrerà risultati di salute nel tuo DNA possono fornire un aplogruppo ma non è facile da usare e non ho avuto fortuna.

Meglio testare a 23andme per ottenere il tuo aplogruppo mtDNA di alto livello o fare il test mtDNA dettagliato su familytreeDNA , probabilmente sarà in vendita poco prima del giorno della mamma.

Dipende dalla versione del chip AncestryDNA usata per genotipizzare il tuo DNA, vedere lintestazione del file. Il sito SNPedia Haplogroup descrive in dettaglio ciò che viene richiesto dalle diverse versioni del chip e potresti passare molte ore manualmente a seguire il ~ 1.700 Y-DNA SNP nel file, per chiamare un aplogruppo di alto livello, in alternativa puoi ottenere la stessa risposta inviando $ 0- $ 12 a Promethease (a seconda della direzione del vento / capriccio dellazienda), che restituirà anche numerosi tratti, diciamo resistenza alla peste / aids, tolleranza al lattosio, tolleranza allalcol, colore degli occhi, tipo di capelli, … per i gettoni di birra.