Finne haplogruppe gjennom rå DNA-data?

Jeg fikk min Y-DNA-haplogruppe fra min AncestryDNA rå DNA-fil ved hjelp av den første metoden som er beskrevet i denne lenken: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

Kort fortalt går det gjennom tre trinn:

1 / du konverterer din AncestryDNA rå DNA-fil til 23andme-format ved hjelp av et lite VBS-program du kan få tak i herfra:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Du må rett og slett legge den i samme katalog som din utpakkede DNA-fil (txt-fil), dobbeltklikk, og den gjør konverteringen og opprett en ny fil i samme katalog som heter yourdnafilename_Edited.txt

2 / Du installerer dette programmet og laster inn DNA-filen i 23andme-format:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(det krever .NET Framework 4.0, så du må kanskje installere det t)

Gå til File -> Save, og lagre i en annen tekstfil

3 / Kopier innholdet i denne tekstfilen til tekstområdet på dette nettstedet, og kjør prediktoren :

https://ytree.morleydna.com/

Du bør få ditt Y-DNA haplogruppe nå, som er resultatet merket «mest sannsynlig». Hvis du får BT eller F som «mest sannsynlig» (de fleste har det, så det er nesten overflødig), så er neste spådom mest sannsynlig (og relevant) for deg (det burde være mer «grønt» i det enn de andre alternativene). Hvis du har et problem eller et spørsmål, kan du enten henvise til artikkelen som er lenket over, eller spør meg. Lykke til!

Kommentarer

• Chris Morley har forenklet ting enda lenger. Bare last inn AncestryDNA (eller MyHeritage eller 23andMe) rådatafilen din her ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal og send deg videre til hans prediksjonsverktøy for haplogruppe.
• Jeg brukte ytree.morleydna.com med min AncestryDNA rådatafil i omtrent 2014, og det fungerte for meg. Ikke ' vet ikke hvis du fortsatt kunne gjøre det i dag … BTW, lenken over ( geneticgenealogist.net/2016/01/… ) fungerer ikke ' ikke lenger for meg.)
• @TJinBC Linken har blitt reaktivert vated.

Min forståelse er at det nåværende normale AncestryDNA-produktet, som tester autosomalt DNA, ikke inkluderer Y-DNA eller mtDNA SNP som vil være nyttige for å bestemme haplogruppen (e) dine.

Ancestry solgte tidligere dyrere DNA-tester for Y-DNA og mtDNA, men gjør ikke lenger. FamilyTreeDNA gjør imidlertid:

https://www.familytreedna.com/

You «ll trenger å laste ned rådata og finne ut haplogruppen selv ved hjelp av ISOGGs database:

https://isogg.org/tree/index.html

Kommentarer

• AncestryDNA selger ikke ' t-DNA og mtDNA-tester. Bare FamilyTreeDNA gjør det.
• Angi hvilken side på ISOGG-nettstedet som vil fortelle deg hvordan du skal finne ut haplogruppen.
• Takk @lkessler, jeg ' har oppdatert svaret mitt (tok meg lang tid! la bare merke til kommentarene dine).

De kaller y-kromosomet for «kromosom 24».

De tester bare 885 SNP-er skjønt.

De tester også 17.604 SNP-er på x-kromosomet (merket som kromosom 23), pluss 440 SNP-er merket som kromosom 25 som er enten fra kromosom X eller fra de pseudoautosomale regionene i Y-kromosomet.

Jeg vet foreløpig ikke noe verktøy for å filtrere disse seksjonene ut for å bestemme haplogrupper, men jeg søker fremdeles.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Kommentarer

• I ' har aldri sett Y-kromosomet kalt " kromosom 24 ". Det gir ingen mening fordi det er 46 kromosomer, i 23 par. De første 22 parene av kromosomer kalles de autosomale kromosomene. X og Y (par 23) kalles sexkromosomene.
• Jeg tror det er gjenstand for AncestryDNA-filformat. Det er det samme csv eller en tabellfil med rådata som ftdna eller 23andme gir. Og det er veldig rimelig å skrive ChrX som Chr23 og ChrY som Chr24 (for eksempel bruker filgenerator heltallstype for kromosomnummer / navngivning)
• I er helt sikker på at AncestryDNA utpeker ChrX som Chr23 fordi det er slik konvertering i nyttige verktøy her: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Jeg overførte min Ancestry autosomale test til dette nettstedet, og det ga meg min haplo-gruppen som samsvarte med Y-testen jeg hadde fra National Geographic og FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry tester nok SNP-er for å få et høyt nivå av haplogruppe. De andre svarene som ble diskutert om å få Y- og Morley-metoden fungerer bra, MEN kvinner har ikke Y, så den eneste haplogruppen de kan få er mtDNA (mitokondrie-DNA).

Laster opp til Promethease.com som vil vise helseresultater i DNA-et ditt kan gi en haplogruppe, men det er ikke lett å bruke, og jeg hadde ikke hell med det. , sannsynligvis i salg rett før morsdagen.

Avhenger av AncestryDNA-brikkeversjonen som ble brukt til å genotype din DNA, se filoverskrift. SNPedia Haplogroup nettstedet beskriver hva som er pollet av de forskjellige chipversjonene, og du kan bruke mange timer på å etterligge ~ 1700 Y-DNA manuelt SNPs i filen, for å kalle et høyt nivå Haplogroup, alternativt kan du få det samme svaret ved å kaste $ 0- $ 12 på Promethease (avhengig av retningen til selskapets vind / innfall), som også vil gi mange egenskaper, sier motstand mot pest / hjelpemidler, laktosetoleranse, alkoholtoleranse, øyenfarge, hårtype, … for øltegnene.