Met awk:

Reacties

• Leuke bijkomstigheid met het totaal!
• Plus kan awk '{print $1}' <inputfile|sort -n|uniq -c verkrijg een samenvatting van de telfrequenties van de tags.
• Indirect inputfile met <, maar ja inderdaad.

De vraag in het hoofdgedeelte

Selecteer regels die beginnen met een 1 en worden gevolgd door een spatie

grep -c "^1\s" file grep -c "^1[[:space:]]" file 

Dat geeft ook het aantal regels (zonder de oproep naar wc)

De vraag in de titel

A 1 niet gevolgd door een ander nummer (of niets):

grep -cE "^1([^0-9]|$)" file 

Maar beide bovenstaande oplossingen hebben enkele interessante kwesties, blijf lezen.

---

In de hoofdtekst van de vraag beweert de gebruiker dat het bestand “door tabs gescheiden” is.

Scheidingsteken

tab

Een regel die begint met wi th a 1 gevolgd door een tab (een daadwerkelijke tab in de opdracht). Dit mislukt als het scheidingsteken een spatie is (of een andere, of geen):

grep "^1 " file 

spatie

Een regel die begint met een 1 gevolgd door een spatie (een werkelijke spatie in het commando). Dit mislukt als het scheidingsteken een ander of geen is .:

grep "^1 " file 

tab of spatie

grep "^1( | )" file grep "^1[[:blank:]]" file 

witruimte

Een meer flexibele optie is om meerdere spaties (horizontale en verticale) tekens op te nemen. De [:space:] -tekenset is samengesteld uit (spatie), \t (horizontale tab ), \r (regelterugloop), \n (nieuwe regel), \v (verticaal tabblad ) en \f (form feed). Maar grep kan niet overeenkomen met een nieuwe regel (het is een interne beperking die alleen kon worden vermeden met de optie -z). Het is mogelijk om het als omschrijving op het scheidingsteken te gebruiken. Het is ook mogelijk, en korter, om de voor GNU beschikbare afkorting van \s te gebruiken:

grep -c "^1[[:space:]]` file grep -c "^1\s" file 

Maar deze optie zal mislukken als het scheidingsteken zoiets is als een dubbele punt : of een ander leesteken (of een willekeurige letter).

Boundary

Of, we kunnen de overgang gebruiken van een cijfer naar een “geen cijfer” grens, nou ja, eigenlijk “een teken niet in [_[:alnum:]] (_a-zA-Z0-9 ) “:

grep -c "^1\b" file # portable but not POSIX. grep -c "^1\>" file # portable but not POSIX. grep -wc "^1" file # portable but not POSIX. grep -c "^1\W" file # portable but not POSIX (not match only a `1`) (not underscore in BSD). 

Dit accepteert als geldige regels die beginnen met een 1 en gevolgd worden door een bepaald leesteken.

Opmerkingen

• Het is onmogelijk dat de regels die door de gebruiker worden gepresenteerd: 1 TGCAG… alleen een 1 (dat wil zeggen: zonder genomische gegevens). Maar hoe dan ook, er kwam ook een haalbare oplossing bij.@St é phaneChazelas

Klinkt net als jij wil dit:

$ grep "^1\b" a 1 TGCAG..... 1 TGCAG...... 

Voor het telgedeelte hiervan:

$ grep -c "^1\b" file 2 

Elk van deze selecteert regels met een 1 in de eerste kolom

awk "$1 == 1" grep -w "^1" 

Deze kunnen beide worden uitgebreid, zodat je de wc niet eens nodig hebt om de regels te tellen

awk "$1==1 { x++ } END { print x }" grep -cw "^1" 

Met grep:

grep -c "^1\s" file 

Dit komt overeen met elke regel die begint met een 1 onmiddellijk gevolgd door witruimte en geeft een telling van die regels (waardoor wc -l)

---

$ cat input 79 TGCAG..... 1 TGCAG..... 1257 TGCAG..... 1 TGCAG...... $ grep -Ec "^1\s" input 2 

Goede antwoorden hier, maar in de veronderstelling dat niet elke regel in een spatie eindigt (zoals als je gaat Als sommige daadwerkelijk uw “=”) halen, kunt u dit gebruiken:

 grep -c "^1[^0-9]" file 

Het komt in principe overeen met elke regel die begint met een, gevolgd door een niet-cijfer, inclusief witruimte. Iets meer uitgebreid, maar ook meer onfeilbaar. (Hoewel het vermeldenswaard is dat er hier niets is voor de null-voorwaarde van slechts-één-op-de-regel, is het niet “end-of-line” gevoelig.)

Opmerkingen

• Merk op dat het regels niet toestaat die alleen bestaan uit 1. Als dat ' s niet gewenst, gebruik bijv. ^1($|[^0-9])

U kunt onderstaande regel ook gebruiken:

$ awk -F" " "{if($1=="1") print $0}" <your file name> | wc -l 

De parameter -F maakt van het veldscheidingsteken een witruimte . Als de waarde van het eerste veld “1” is, wordt de regel ervan afgedrukt.