Găsiți haplogrup prin date ADN brute?

Am obținut haplogrupul meu Y-ADN din fișierul meu ADN brut AncestryDNA folosind prima metodă detaliată în acest link: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

Pe scurt, parcurge 3 pași:

1 / vă convertiți fișierul de ADN brut AncestryDNA în format 23andme folosind un mic program VBS pe care îl puteți obține de aici:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Pur și simplu trebuie să-l puneți în același director cu fișierul ADN nezipat (fișier txt), faceți dublu clic și va face conversia și creați un fișier nou în același director numit yourdnafilename_Edited.txt

2 / Instalați acest program și încărcați fișierul ADN în format 23andme în acesta:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(necesită .NET Framework 4.0, deci este posibil să trebuiască să instalați acel fir t)

Accesați Fișier -> Salvați și salvați într-un alt fișier text

3 / Copiați conținutul acestui fișier text în zona de text de pe acest site web și rulați predictorul :

https://ytree.morleydna.com/

Ar trebui să obțineți ADN-ul dvs. haplogroup acum, care este rezultatul etichetat „cel mai probabil”. Dacă primiți BT sau F ca „cel mai probabil” (majoritatea oamenilor le au, deci este aproape redundant), atunci următoarea predicție este cea mai probabilă (și relevantă) pentru dvs. (ar trebui să existe mai mult „verde” în ea decât celelalte opțiuni). Dacă aveți o problemă sau o întrebare, fie consultați articolul legat mai sus, fie întrebați-mă. Noroc!

Comentarii

• Chris Morley a simplificat lucrurile și mai mult. Încărcați fișierul de date brute AncestryDNA (sau MyHeritage sau 23andMe) aici ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal și fiți redirecționat la instrumentul său de predicție haplogrup.
• Am folosit ytree.morleydna.com cu fișierul meu de date brute AncestryDNA în aproximativ 2014 și a funcționat pentru mine. Nu ‘ nu știu dacă tot ai putea să o faci astăzi … BTW, linkul de mai sus ( geneticgenealogist.net/2016/01/… ) nu mai funcționează pentru mine ‘.)
• @TJinBC Link-ul a fost react învechit.

Înțeleg că produsul AncestryDNA normal curent, care testează ADN-ul autosomal, nu include SNP-uri ADN-Y sau ADN-mt care ar fi utile pentru determinarea haplogrupului (grupurilor) dvs.

Antenii vândeau anterior teste ADN mai scumpe pentru ADN-Y și ADNmt, dar nu mai fac. FamilyTreeDNA face totuși:

https://www.familytreedna.com/

trebuie să descărcați datele brute și să descoperiți singur haplogrupul folosind baza de date ISOGG:

https://isogg.org/tree/index.html

Comentarii

• AncestryDNA nu ‘ nu vinde teste Y-DNA și mtDNA. Doar FamilyTreeDNA o face.
• Vă rugăm să specificați ce pagină de pe site-ul ISOGG vă va spune cum să aflați haplogrupul.
• Mulțumesc @lkessler, eu ‘ mi-am actualizat răspunsul (mi-a luat suficient timp! tocmai am observat comentariile dvs.).

Ei numesc cromozomul y „cromozomul 24”.

Testează doar 885 SNP „s.

De asemenea, testează 17.604 SNP” pe cromozomul x (etichetat ca cromozomul 23), plus 440 SNP etichetați ca cromozomul 25 care sunt fie din cromozomul X, fie din regiunile pseudoautozomale ale cromozomului Y.

Deocamdată nu știu un instrument pentru filtrarea acestor secțiuni pentru a determina haplogrupuri, dar încă mai caut.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Comentarii

• I ‘ nu am văzut niciodată cromozomul Y numit ” cromozomul 24 „. Asta nu are sens deoarece există 46 de cromozomi, în 23 de perechi. Primele 22 de perechi de cromozomi se numesc cromozomi autozomali. X și Y (perechea 23) se numesc cromozomi sexuali.
• Cred că este un artefact al formatului de fișier AncestryDNA. Este același csv sau fișier tabelat cu date brute, cum ar fi ftdna sau 23andme. Și este foarte rezonabil să scrieți ChrX ca Chr23 și ChrY ca Chr24 (de exemplu, generatorul de fișiere utilizează tip întreg pentru numărul / denumirea cromozomilor)
• I Sunt total sigur că AncestryDNA desemnează ChrX ca Chr23 deoarece există o astfel de conversie în utilitățile utile aici: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Am transferat testul autosomal Ancestry pe acest site și mi-a dat grup haplo care s-a potrivit cu testul Y pe care l-am avut de la National Geographic and FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry testează suficiente SNP-uri pentru a obține un haplogrup de nivel înalt. Celelalte răspunsuri discutate despre obținerea metodei Y și Morley funcționează bine DAR femeile nu au un Y, deci singurul haplogrup pe care îl pot obține este ADNmt (ADN mitocondrial).

Încărcarea pe Promethease.com care va arăta rezultatele sănătății în ADN-ul dvs. pot oferi un haplogrup, dar nu este ușor de utilizat și nu am avut noroc cu el.

Cel mai bine este să testați la 23andme pentru a obține haplogrupul dvs. de ADNmt de nivel înalt sau faceți testul detaliat al ADNmt la familytreeDNA , probabil să fie la vânzare chiar înainte de ziua mamei.

Depinde de versiunea cip AncestryDNA utilizată pentru a vă genotipa ADN, consultați antetul fișierului. Site-ul SNPedia Haplogroup detaliază ceea ce este chestionat de diferitele versiuni de cipuri și puteți petrece o oră manual urmărind ~ 1.700 Y-DNA SNP-uri în fișier, pentru a apela un grup Haplogroup de nivel înalt, alternativ puteți obține același răspuns aruncând 0 $ – 12 $ la Promethease (în funcție de direcția vântul / capriciul companiei), care va oferi, de asemenea, numeroase trăsături, cum ar fi rezistența la ciumă / ajutoare, tolerarea lactozei, toleranța la alcool, culoarea ochilor, tipul de păr, … pentru jetoanele de bere.