Hitta haplogrupp genom rå DNA-data?

Jag fick min Y-DNA-haplogrupp från min AncestryDNA rå DNA-fil med den första metoden som beskrivs i den här länken: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

Kort sagt går det igenom tre steg:

1 / du konverterar din AncestryDNA raw DNA-fil till 23andme-format med ett litet VBS-program som du kan hämta härifrån:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Du måste helt enkelt lägga den i samma katalog som din unzippade DNA-fil (txt-fil), dubbelklicka, och det gör konverteringen och skapa en ny fil i samma katalog med namnet yourdnafilename_Edited.txt

2 / Du installerar det här programmet och laddar DNA-filen i 23andme-format:

drive.google.com/uc ? export = nedladdning & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(det kräver .NET Framework 4.0, så du kan behöva installera det t)

Gå till Arkiv -> Spara och spara i en annan textfil

3 / Kopiera innehållet i denna textfil till textområdet på den här webbplatsen och kör prediktorn :

https://ytree.morleydna.com/

Du borde få ditt Y-DNA haplogrupp nu, vilket är resultatet märkt ”troligtvis”. Om du får BT eller F som ”mest troligt” (de flesta har sådana, så det är nästan överflödigt), är nästa förutsägelse den mest troliga (och relevanta) för dig (det borde vara mer ”grönt” i det än de andra alternativen). Om du har ett problem eller en fråga, hänvisa antingen till artikeln som länkas ovan eller fråga mig. Lycka till!

Kommentarer

• Chris Morley har förenklat saker ännu mer. Ladda bara din AncestryDNA (eller MyHeritage eller 23andMe) rådatafil här ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal och bli vidarebefordrad till hans förutsägelsesverktyg för haplogrupp.
• Jag använde ytree.morleydna.com med min AncestryDNA rådatafil ungefär 2014 och det fungerade för mig. Vet inte ’ om du fortfarande kunde göra det idag … BTW, länken ovan ( geneticgenealogist.net/2016/01/… ) fungerar inte ’ för mig längre.)
• @TJinBC Länken har reagerats vated.

Min uppfattning är att den nuvarande normala AncestryDNA-produkten, som testar autosomalt DNA, inte inkludera Y-DNA eller mtDNA SNP som skulle vara användbara för att bestämma dina haplogrupper.

Ancestry sålde tidigare dyrare DNA-test för Y-DNA och mtDNA, men gör inte längre. FamilyTreeDNA gör dock:

https://www.familytreedna.com/

You ”ll måste ladda ner rådata och räkna ut haplogruppen själv med ISOGG: s databas:

https://isogg.org/tree/index.html

Kommentarer

• AncestryDNA säljer inte ’ t-Y-DNA- och mtDNA-tester. Det är bara FamilyTreeDNA som gör det.
• Ange vilken sida på ISOGG-webbplatsen som berättar hur du ska ta reda på haplogruppen.
• Tack @lkessler, jag ’ har uppdaterat mitt svar (tog mig tillräckligt lång tid! Jag märkte bara dina kommentarer).

De kallar y-kromosomen ”kromosom 24”.

De testar bara 885 SNP ”s dock.

De testar också 17.604 SNP” s på x-kromosomen (märkt som kromosom 23), plus 440 SNP märkta som kromosom 25 som är antingen från kromosom X eller från de pseudoautosomala regionerna i Y-kromosomen.

Jag känner ännu inte till något verktyg för att filtrera ut dessa avsnitt för att bestämma haplogrupper men jag söker fortfarande.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Kommentarer

• I ’ har aldrig sett Y-kromosomen som heter ” kromosom 24 ”. Det är ingen mening eftersom det finns 46 kromosomer, i 23 par. De första 22 paren av kromosomer kallas autosomala kromosomer. X och Y (par 23) kallas sexkromosomer.
• Jag tror att det är artefakt av AncestryDNA-filformat. Det är samma csv eller en tabellfil med rådata som ftdna eller 23andme tillhandahåller. Och det är mycket rimligt att skriva ChrX som Chr23 och ChrY som Chr24 (till exempel använder filgeneratorn heltalstyp för kromosomnummer / namngivning)
• I är helt säker på att AncestryDNA betecknar ChrX som Chr23 eftersom det finns sådan konvertering i användbara verktyg här: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Jag överförde mitt Ancestry autosomaltest till den här webbplatsen och det gav mig min haplo-grupp som matchade det Y-test jag hade från National Geographic och FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry testar tillräckligt många SNP för att få en hög nivå i haplogruppen. De andra svaren som diskuterats om att få Y- och Morley-metoden fungerar bra MEN kvinnor har inte ett Y så den enda haplogruppen de kan få är mtDNA (mitokondriellt DNA).

Uppladdning till Promethease.com som visar hälsoresultat i ditt DNA kan ge en haplogrupp men det är inte lätt att använda och jag hade ingen tur med det.

Bäst att testa vid 23andme för att få din höga mtDNA-haplogrupp eller göra det detaljerade mtDNA-testet på familytreeDNA , kommer sannolikt att säljas strax före mors dag.

Beror på AncestryDNA-chipversionen som används för att genotypa din DNA, se filrubrik. Sidan SNPedia Haplogroup beskriver vad som frågas av de olika chipversionerna och du kan spendera många timmar manuellt på att följa ~ 1700 Y-DNA SNP i filen, för att ringa en Haplogroup på hög nivå, alternativt kan du få samma svar genom att kasta $ 0- $ 12 på Promethease (beroende på riktningen för företagets vind / infall), som också kommer att återge många egenskaper, säg motstånd mot pest / hjälpmedel, laktostolerans, alkoholtolerans, ögonfärg, hårtyp, … för ölpenna.