Jag har en polymetinmolekyl med låt oss säga 9 $ \ ce {C} $ atomer.
$ \ ce {H-CH = CH-CH = CH-CH = CH-CH = CH-CH3} $
Hur kan jag beräkna längden på hela molekylen?
Jag behöver detta tal för att beräkna de våglängder som molekylen kommer att absorbera (modell för linjär potentialbrunn).
Så vad är de genomsnittliga bindningslängderna och bindningsvinklarna i denna molekyl och hur beräknas de?
EDIT: Ett annat exempel för polymetin (bara den röda delen av den):
Svar
Så vilka är de genomsnittliga bindningslängderna och bindningsvinklarna i denna molekyl och hur beräknas de?
1,3-butadien bör fungera som en rimlig modell för din arbete.
Vi kan hitta bindningslängderna i litteraturen. Dubbelbindningslängd kol-kol är 1,338 Å, typiskt för en dubbelbindning ( referens ). Enkelbindningslängden kol-kol är 1,454 Å, kortare än väntat på grund av resonans. Alla kol är $ \ ce {sp ^ 2} $ hybridiserade, vilket innebär att alla bindningsvinklar ska vara ~ 120 °.
Med denna information och vektortillägg kan du bestämma längden på valfri polymetin.
Kommentarer
- 1.338 Â är 0.1338nm, eller hur? Sedan är varje dubbelbindning 0.1338nm * sin (60 °) = 0.1159nm och varje enskild bindning är 0.1454nm * sin (60 ° ) = 0,1259 nm projicerad till axeln genom molekylkedjan. Det skulle leda mig till slutsatsen att min molekyl ovan (4 C = C och 4 C-C-bindningar) är ungefär 0,9672 nm lång. Eller missförstod jag dig?
- Precis på nm. Kunde du inte ' t lägga till hela C = C-bindningslängden plus 0.1454 * cos (60 °)?
- Jag tror inte '. Jag behöver molekylens längd, vilket är avståndet mellan C-atomen i vardera änden, förutsatt att molekylen har alternerande bindningsvinkelriktningar (ser ut som exempelbilden som läggs till i frågan).
- Ditt sätt gör känsla och jag får samma slutnummer som du.
- @InternetGuy Nej, resonansstrukturer som involverar laddningsseparation räknas inte lika mycket som neutrala resonansstrukturer när det gäller att beskriva molekylen.
Svar
Tänk i en kedja av trianglar.
Med tanke på att avståndet mellan C1 och C2 (= $ a $), avståndet mellan C2 och C3 (= $ b $) och bindningsvinkeln $ \ gamma $ är kända är avståndet mellan C1 och C3
$ c = \ sqrt {a ^ 2 + b ^ 2 -2ab \ cos \ gamma} $
(cosinusregel)
Svar
Om du har en webbplatslicens (eller en torrent) för att använda ChemDraw kan du skapa en 3D-modell av en sådan struktur och o ptimera det för att hitta den mest stabila konfigurationen. Det ger dig bindningsvinklarna på var och en till en hög grad av noggrannhet. Du kan också använda MM2-funktionen för att optimera och hitta bindningslängder. ChemDraw ger dig en enkel lista. Det kan också generera bindningsrotationer, men du kan satsa på att det konjugerade pi-systemet kommer att förbli plant, eftersom energibarriären för rotation kring sp2-kolbindningarna är mycket hög.
Om du använder en enkel endimensionell partikel-i-en-låda-modell, längden L för " rutan " skulle vara längden på det konjugerade systemet. Detta skulle vara den väg längs vilken elektroner är konjugerade. Det är inte precis den ojämna linjen mellan alla sp2-kol, men det är ganska nära, så du kan säga L = (antal bindningar i konjugerat system) x (genomsnittlig längd för dessa bindningar). Observera att detta absolut inte är avståndet mellan C1-C3-C5-etc. kol som den andra killen nämnde – jag tror inte att han förstår exakt vad du försöker beräkna.
Med den här modellen kan du beräkna våglängden för maximal absorption från kvantantalet HOMO-LUMO övergångar. Titta på ekvationen:
I denna ekvation är nf och ni de elektroniska kvantnummer för den slutliga och initialtillstånd för en övergångselektron, h är Plancks konstant, m är massan av en elektron och L är som beskrivits tidigare. Mängden inom parentes förenklar till N + 1, eftersom ni = N / 2 och nf = N / 2 + 1, där N är antalet pi-elektroner i det konjugerade systemet. För att förstå detta begreppsmässigt kommer marktillståndet för en molekyl att fyllas så att de N / 2 lägsta energinivåerna kommer att fyllas (eftersom elektroner fyller dem i par ), och alla högre energinivåer är tomma.När det absorberar ljus hoppar en av dess elektroner från den högsta fyllda energinivån (HOMO, med ni = N / 2) till den lägsta ofyllda nivån (LUMO, med nf = N / 2 + 1). Det är viktigt att förstå att om en elektron främjas kan den inte helt enkelt hoppa över en energinivå, så om du vet antalet pi-elektroner vet du också vad HOMO-LUMO-övergången kommer att bli. Om du kan räkna antalet pi-elektroner i det konjugerade systemet (t.ex. 1,6-difenyl-1,3,5 hexatrien har 3 dubbelbindningar i sin låda, vilket betyder 6 pi-elektroner), kan du använda denna ekvation för att hitta önskad våglängd för maximal absorption. Visst har du sett den klassiska ekvationen:
där c är ljusets hastighet. Om du ersätter detta till den första ekvationen du borde kunna lösa för våglängden för maximal absorption. Tänk på dina enheter!