Finde haplogruppe gennem rå DNA-data?

Jeg har fået min Y-DNA-haplogruppe fra min AncestryDNA rå DNA-fil ved hjælp af den første metode, der er beskrevet i dette link: https://www.geneticgenealogist.net/2016/01/how-to-get-ydna-haplogroup-from.html

Kort fortalt går det gennem 3 trin:

1 / du konverterer din AncestryDNA rå DNA-fil til 23andme-format ved hjælp af et lille VBS-program, du kan få herfra:

drive.google.com/file/d/0ByaSZfKQX51lNHJSSUlsNGxTQmM/view

Du skal simpelthen placere den i samme bibliotek som din ikke-zip-DNA-fil (txt-fil), dobbeltklik, og det gør konverteringen og opret en ny fil i samme bibliotek med navnet yourdnafilename_Edited.txt

2 / Du installerer dette program og indlæser dna-filen i 23andme-format i det:

drive.google.com/uc ? export = download & id = 0B7vzRsRM2aOQcU5fckNjdEg1ZWs

(det kræver .NET Framework 4.0, så du bliver muligvis nødt til at installere det, der t)

Gå til File -> Save, og gem i en anden tekstfil

3 / Kopier indholdet af denne tekstfil til tekstområdet på dette websted, og kør forudsigeren :

https://ytree.morleydna.com/

Du skal få dit Y-DNA haplogroup nu, hvilket er resultatet mærket “mest sandsynligt”. Hvis du får BT eller F som “mest sandsynligt” (de fleste har dem, så det er næsten overflødigt), så er den næste forudsigelse den mest sandsynlige (og relevante) for dig (der burde være mere “grøn” i den end de andre muligheder). Hvis du har et problem eller et spørgsmål, skal du enten henvise til artiklen linket ovenfor eller spørge mig. Held og lykke!

Kommentarer

• Chris Morley har forenklet tingene yderligere. Indlæs bare din AncestryDNA (eller MyHeritage eller 23andMe) rådatafil her ytree.morleydna.com/extractFromAutosomal og send dig videre til hans værktøj til forudsigelse af haplogrupper.
• Jeg brugte ytree.morleydna.com med min AncestryDNA rå datafil omkring 2014, og det fungerede for mig. Ved ikke ‘ hvis du stadig kunne gøre det i dag … BTW, linket ovenfor ( geneticgenealogist.net/2016/01/… ) virker ‘ ikke længere for mig.)
• @TJinBC Linket har været reageret vated.

Min forståelse er, at det nuværende normale AncestryDNA-produkt, der tester autosomalt DNA, ikke inkluderer Y-DNA eller mtDNA SNPer, der ville være nyttige til bestemmelse af dine haplogrupper.

Ancestry solgte tidligere dyrere DNA-tests for Y-DNA og mtDNA, men gør det ikke længere. FamilyTreeDNA gør dog:

https://www.familytreedna.com/

You “ll har brug for at downloade rådataene og finde ud af haplogruppen selv ved hjælp af ISOGGs database:

https://isogg.org/tree/index.html

Kommentarer

• AncestryDNA sælger ikke ‘ t Y-DNA og mtDNA-test. Kun FamilyTreeDNA gør det.
• Angiv venligst hvilken side på ISOGG-webstedet, der fortæller dig, hvordan du finder ud af haplogruppen.
• Tak @lkessler, jeg ‘ har opdateret mit svar (tog mig lang tid! bemærkede bare dine kommentarer).

De kalder y-kromosomet “kromosom 24”.

De tester dog kun 885 SNPer.

De tester også 17.604 SNPer på x-kromosomet (mærket som kromosom 23) plus 440 SNPer mærket som kromosom 25, der er enten fra kromosom X eller fra de pseudoautosomale regioner i Y-kromosomet.

Jeg kender endnu ikke et værktøj til at filtrere disse sektioner for at bestemme haplogrupper, men jeg søger stadig.

http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart

Kommentarer

• I ‘ har aldrig set Y-kromosomet kaldet ” kromosom 24 “. Det giver ingen mening, fordi der er 46 kromosomer i 23 par. De første 22 par kromosomer kaldes de autosomale kromosomer. X og Y (par 23) kaldes sexkromosomer.
• Jeg synes, det er artefakt af AncestryDNA-filformat. Det er det samme csv eller tabuleret fil med rådata som ftdna eller 23andme giver. Og det er meget rimeligt at skrive ChrX som Chr23 og ChrY som Chr24 (for eksempel bruger filgenerator heltalstype til kromosomnummer / navngivning)
• I er helt sikker på, at AncestryDNA udpeger ChrX som Chr23, fordi der er en sådan konvertering i nyttige hjælpeprogrammer her: y-str.org/2014/09/autosomal-dna-converter-nix.html

Jeg overførte min Ancestry autosomale test til dette websted, og det gav mig min haplo-gruppe, der matchede Y-testen, jeg havde fra National Geographic og FamilyTree:

https://ytree.morleydna.com/ extractFromAutosomal

Ancestry tester nok SNPer til at få et højt niveau af haplogruppe. De andre svar, der blev diskuteret, om at få Y- og Morley-metoden fungerer godt, MEN kvinder har ikke et Y, så den eneste haplogruppe, de kan få, er mtDNA (mitokondrie-DNA).

Uploading til Promethease.com, som viser sundhedsresultater i dit DNA kan give en haplogruppe, men det er ikke let at bruge, og jeg havde ikke held med det.

Bedst at teste ved 23andme for at få din høje niveau mtDNA-haplogruppe eller lave den detaljerede mtDNA-test på familytreeDNA , sandsynligvis til salg lige før mors dag.

Afhænger af AncestryDNA-chipversionen, der blev brugt til at genotype din DNA, se filoverskrift. SNPedia Haplogroup webstedet beskriver, hvad der polles af de forskellige chipversioner, og du kan bruge mange timer manuelt på at efterspore ~ 1.700 Y-DNA SNPer i filen for at kalde et Haplogroup på højt niveau, alternativt kan du få det samme svar ved at kaste $ 0- $ 12 på Promethease (afhængigt af retningen af firmaets vind / indfald), som også vil returnere adskillige træk, f.eks. modstandsdygtighed over for pest / hjælpemidler, laktosetolerering, alkoholtolerance, øjenfarve, hårtype, … for øltegnene.